生物膜复合填料在水利工程中起到重要作用，主要体现在以下几个方面：

首先，生物膜复合填料可以提高水处理效率。生物膜复合填料具有大量的微生物附着表面，能提供良好的附着生物膜生长环境，有利于水中有机物和氮磷等营养物质的去除。通过生物膜的生物降解和生物吸附作用，可以有效净化水质，提高水处理效率。

其次，生物膜复合填料可以提高水利工程的运行稳定性。生物膜复合填料可以增加废水处理系统中微生物的生物量和多样性，提高系统对外界环境变化的适应能力，减少系统运行过程中的波动性，从而提高系统的运行稳定性和可靠性。

此外，生物膜复合填料可以减少水利工程的维护成本。生物膜复合填料具有较长的使用寿命，不易磨损和老化，可以降低设备更换和维护成本。同时，生物膜复合填料在使用过程中不需要额外的化学药剂，减少了水利工程运行中的化学药剂投入和管理成本。

生物膜复合填料还可以促进水利工程的生态修复和生态保护。生物膜复合填料提供了良好的微生物生长环境，有利于水中有机物和重金属的生物降解和吸附，促进水体生态系统的恢复和改善，保护水资源和生物多样性。

总的来说，生物膜复合填料在水利工程中的作用是多方面的，包括提高水处理效率、增强系统的运行稳定性、降低维护成本和促进生态修复和保护。因此，在水利工程设计和运行中，应充分考虑生物膜复合填料的应用，以提高水质净化效果，保障水资源的可持续利用。